Kapan varian Omicron Covid tiba di Inggris dan menyebar? | Virus corona

Ketika kasus baru Omicron terus muncul di Inggris, para ilmuwan bekerja sepenuhnya untuk menjawab dua pertanyaan penting: Kapan varian itu tiba dan apakah itu menyebar?

Meskipun pada pandangan pertama pertanyaan-pertanyaan ini mungkin tampak kurang penting daripada pertanyaan-pertanyaan di sekitar mereka Kemanjuran vaksin Atau tingkat keparahan penyakitnya, jawabannya mungkin memberikan petunjuk penting tentang apa yang akan datang.

Jika Omicron telah berada di Inggris selama berbulan-bulan, tetapi baru ditemukan sekarang, ini dapat menunjukkan bahwa varian tersebut tidak mungkin dengan cepat melampaui Delta dan menyebabkan peningkatan infeksi atau lonjakan signifikan dalam rawat inap dan kematian. Namun, gambar tersebut kurang pasti jika masih baru.

Afrika Selatan mengumumkan kasus pertama Omicron pada 24 November, dan sampel positif pertama kembali pada 9 November. Sejak itu telah ditemukan di banyak negara di seluruh dunia, termasuk Inggris, di mana Kasus pertama telah dilaporkan Pada 27 November di Inggris, dua orang memiliki ikatan untuk melakukan perjalanan ke Afrika Selatan. Hingga Selasa, ada 22 kasus di Inggris dan Skotlandia.

Tetapi kasus pertama yang diketahui berbeda dari infeksi pertama. Profesor Oliver Pepos, co-direktur Program Oxford Martin School di Epidemiologi Genomics, mengatakan bahwa dalam bacaannya, Omicron kemungkinan akan beredar setidaknya selama satu bulan.

“Kemungkinan penyebaran internasional mulai menjelang akhir Oktober,” katanya.

Dr Richard Lisels, seorang dokter penyakit menular di Universitas KwaZulu-Natal di Durban, menambahkan bahwa kebangkitan pada bulan Oktober adalah “masuk akal” mengingat ini adalah akhir dari ekor gelombang delta di Afrika Selatan. “Ini konsisten dengan bagaimana dan kapan kami melihat munculnya variabel mengkhawatirkan lainnya; misalnya, variabel beta muncul tahun lalu menjelang akhir gelombang pertama.”

Lisels mengatakan bahwa pekerjaan analitis untuk memperkirakan waktu munculnya Omicron berfokus pada membandingkan pola perubahan genetik yang terakumulasi dari waktu ke waktu dalam sampel yang berbeda dari varian Omicron.

Namun dalam mendeteksi kasus Omicron, ada sejumlah tantangan.

Banyak orang dengan Covid tidak menjalani tes PCR, sementara jumlah besar kasus Covid di Inggris saat ini berarti, meskipun tingkat pengawasannya tinggi, hanya sekitar 20% sampel PCR yang dianalisis secara rutin untuk mengidentifikasi varian yang dimaksud.

Untuk memajukan penelitian, latihan penelusuran aktif sedang berlangsung di seluruh Inggris, termasuk latihan ‘pengulangan’, di mana sampel PCR yang dikumpulkan sebelumnya dianalisis untuk menentukan varian mana yang dikandungnya.

Salah satu faktor yang membantu upaya tersebut adalah Omicron memiliki mutasi yang berarti menunjukkan negatif dalam tes untuk gen coronavirus S. Ini juga terjadi pada varian alfa, tetapi bukan varian delta, yang berarti tes dapat memberikan hasil yang cepat. indikasi – meskipun Mereka tidak konklusif – tentang apakah sampel mungkin mengandung Omicron, memungkinkan upaya pelacakan kontak yang cepat.

Nicola Sturgeon, Menteri Pertama Skotlandia, membenarkan bahwa latihan berulang telah mengarah pada identifikasi enam kasus di Skotlandia diumumkan pada hari Senin; Pejabat kesehatan telah mengungkapkan bahwa mereka sedang melihat tes PCR sejak 16 November.

Namun, Dr Jeffrey Barrett, yang memimpin inisiatif genomik Covid-19 di Wellcome Sanger Institute, mengatakan pengawasan rutin tampaknya telah menemukan kasus Omicron pertama yang diketahui di Inggris Tidak mungkin alternatif itu akan hadir di Inggris untuk waktu yang lama.

“Kami memiliki pemantauan yang baik, jadi tidak ada peluang Omicron di Inggris pada September atau Oktober,” katanya kepada Guardian. “Mungkin saja kami tidak mendapatkan serialisasi pertama dari kasus ini, tetapi hampir pasti terjadi pada bulan November.”

READ  Sri Lanka: Penjabat Presiden Ranil Wickremesinghe mengatakan pemerintah sebelumnya "menyembunyikan fakta" tentang krisis keuangan

Tapi tanggal kedatangan Omicron bukan satu-satunya hal yang mendesak. Antara lain, apakah benar-benar ada beberapa tingkat penularan komunitas. Jika itu masalahnya, para ahli memperingatkan Puluhan kasus bisa berubah menjadi ratusan Hanya dalam 10 hari atau lebih.

Sementara Menteri Pertama Skotlandia, Nicola Sturgeon, mengungkapkan bahwa semua sembilan kasus Omicron yang terdeteksi sejauh ini di Skotlandia telah dikaitkan dengan satu peristiwa khusus pada 20 November, tidak ada pada orang dengan riwayat perjalanan baru-baru ini ke negara-negara di Afrika Selatan. dengan orang lain yang pernah bepergian ke sana.

Seperti yang dicatat oleh Profesor Roland Kao, seorang ahli epidemiologi di Universitas Edinburgh, sementara mungkin ada sembilan laporan dari semua kasus di Skotlandia, mungkin ada perkenalan lain dan kontak orang lain di acara tersebut.

Dengan Delapan kasus Omicron Dilaporkan di Inggris pada hari Selasa, sehingga total Inggris menjadi 22, upaya pengujian dan penelusuran terus berlanjut.

Namun dalam perlombaan untuk memahami variabel, tampaknya masih ada jalan panjang.